经过几天的翻阅文档和实验，终于找到了比较好的解决办法。
可以不需要修改my.ini。
在建立数据库的时候，对库和表的字符集设置不太重要，但是对文本类型的字段最好都设置为GBK字符集。
对于已有的数据库可以用以下方法转换字段编码：
ALTER TABLE t MODIFY hoverfly BINARY(100);
ALTER TABLE t MODIFY hoverfly CHAR(100) CHARACTER SET gbk;
注意用此方法如果不修改程序，会发现查询出的结果都是乱码，可以通过在my.ini的[mysqld]段内加default-character-set=gbk来纠正。但是这样你会发现那些没有转换编码的文本字段里的中文都是乱码。
其实有更简单的办法，在进行查询前，只要执行SET character_set_results = NULL就可以。而且这是不管是转换了的还是没转换的字段都不会出现乱码。而转换了的字段可以正常的对中文进行排序。